Najczęstszym problemem, z jakim przychodzą zwierzęta na wizytę są biegunki. Mogą mieć one różne podłoża, a zadaniem gastrologa jest znalezienie przyczyny i wyeliminowanie jej. Gastroenterologia to dziedzina medycyny, która oprócz chorób chorób jelit zajmuje się chorobami przełyku, żołądka, wątroby.
Do diagnostyki chorób przewodu pokarmowego wykorzystuje się szeroką gamę parametrów biochemicznych krwi, badanie ultrasonograficzne oraz rentgenowskie.